本校電腦科設立於1999年，為學生提供與時並進的資訊科技教學課程。隨著資訊科技世界一日千里，由最初學習基本電腦知識、操作處理、互聯網應用等，至現在運算思維、創新科技、媒體及資訊素養等，課程亦不斷更新求變，以迎合教育趨勢。
課堂以外，電腦科亦為不同學習階段的學生，提供多元化的學習經歷。早在保良局何壽南小學上午校時代，已成立「雷霆小組」，即現時「校園電視台小記者」的前身，讓學生有機會訪問校長。到保良局錦泰小學初期，亦舉辦不同活動，邀請保良局屬下幼稚園的學生到校一同學習，並由本校學生負責教授，為各階層學生提供不同學習經歷。近年，電腦科加入運算思維及創新科技等課程，經不同的途徑，申請校外資源，為有興趣的學生提供不同種類的培訓，並積極參加比賽，擴闊學生視野。
歷年在資訊科技方面獲得的獎項超過300個，其中包括「校際 I T 精英挑戰賽-小學組全港冠軍」、「電腦數描大賽-金獎」、「馬拉松101報章小記者及電視小記者」— 網上最受歡迎電視片段大獎、網上最受歡迎主播獎、最具創意獎及最佳攝影獎及「全港小學生運算思維比賽」— 最佳學科應用獎及最佳編程技能獎」等。
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